業務案内

  1. Home
  2. 業務案内
  3. オミクス解析
  4. Affymetrix 遺伝子発現解析

Affymetrix 遺伝子発現解析

FFPEサンプル

 

概要 / 特徴

■概要

 本受託解析は、動物実験後に得られるFFPE(Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded)の組織切片を本機構にお送りいただくだけで、Affymetrix社の3’IVT Arrayを使用し、網羅的に遺伝子発現解析を行い、高品質なデータをご提供するものです。

  • 画像
■特徴
  • 微量total RNAからも解析が可能
    50 ng以上のtotal RNAからでも遺伝子発現解析が可能です。
  • 分解が進んだRNAからも解析が可能
    分解が進んだRNAであっても、ナノレベルのtotal RNAからマイクロレベルのcDNAへ増幅が可能です。
ページの先頭へ戻る

サービス内容

 以下のような流れで受託解析を実施します。基本メニューとしてはお客様からtotal RNAをご送付いただくことからスタートします。

  • 受託解析の流れ
    受託解析の流れ
RNA品質検定
  • 微量分光光度計によるRNA濃度の測定
  • バイオアナライザによるRNA品質の確認
マイクロアレイ実験
  • ラベル化cDNAの合成
  • ラベル化cDNAの濃度・Cy3取り込み効率確認
  • 目的とするマイクロアレイアレイとのハイブリダイゼーション
  • 洗浄/スキャニング
データ解析
  • 数値化、簡易解析(変動遺伝子リスト作成)
  • データマイニング(オプションとして様々なメニューをご用意しています)
ページの先頭へ戻る

納品物 / 納期

 報告書(印刷物)以外に、以下のデータを電子ファイルとして納品します。なお、報告書には方法、結果(考察)を含みます。

納品物 (1)解析結果報告書(ハードコピー)
(2)RNA品質検定結果(Excel及びPDFファイル)
(3)画像データ(TIFFファイル)
(4)数値化データ(Textファイル)
(5)QCレポート結果(Textファイル)
納期 約4週間(サンプル受領から)
ページの先頭へ戻る

サンプル

マイクロアレイ解析からご依頼の場合
種類  total RNA(カラムフィルターで精製)
サンプル量 200 ng以上
濃度 50 ng/μL以上
溶媒 Nuclease Free水(DEPC水不可)
A260/A280 1.8以上
A260/A230 1.0程度以上
FFPEからのRNA抽出からご依頼の場合
種類  FFPE
サンプル厚 3〜10 μm
枚数 4枚以上

*サンプルは返却しませんので、必要量をお送りください。
*上記基準に満たない場合はご相談ください。
*ヒト臨床サンプルの場合、HIV、HCV等感染性のあるサンプルは受領できません。
*ご提供いただくRNAやFFPEサンプルの状態によって結果が大きく左右されます。ご了承の上、お申し込みください。

ページの先頭へ戻る

価格

 本解析の価格に関しましては、本機構までお問い合わせください。

 お問い合わせ先はこちら

お申し込み方法

  • ご依頼の目的など、こちらのフォームより可能な限り詳しくお知らせください。具体的な解析内容については、お客様とご相談の上決定させていただきますので、お気軽にお問い合わせください。
  • その他一般的なご依頼・ご相談手順についてはこちらをご覧ください。
  • ご相談の内容に基づき、費用・納期等をお知らせします。
  • お見積り内容にご承諾いただけましたら、契約手続きに入らせていただきます。
  • その後、サンプルを本機構までご送付ください。サンプルの送付方法についてはこちらを参考にしてください。
    なお、土日祝祭日はサンプルの受け取りができませんので、平日の9時から17時に本機構着となりますように、冷凍(ドライアイス同梱)にてお送りください。