本受託解析は、RNAサンプル又は対象組織や細胞を本機構にお送りいただくだけで、Agilent社のmiRNAマイクロアレイを使用して網羅的に発現解析を行い、高品質なmiRNAアレイデータをご提供するものです。
以下のような流れで受託解析を実施します。基本メニューとしてはお客様からtotal RNAをご送付いただくことからスタートします。
RNA品質検定 |
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マイクロアレイ実験 |
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データ解析 |
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報告書(印刷物)以外に、以下のデータを電子ファイルとして納品いたします。なお、報告書には方法、結果(考察)を含みます。
納品物 | (1)解析結果報告書(ハードコピー) (2)RNA品質検定結果(Excel及びPDFファイル) (3)画像データ(TIFFファイル)* (4)数値化データ(Textファイル) (5)QCレポート結果(Textファイル) |
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納期 | 約3週間(サンプル受領から) |
*ご依頼内容によってはお渡しできない場合もあります
以下の条件に合ったtotal RNAサンプルをご準備ください。
種類 | total RNA(カラムフィルターで精製)※ |
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サンプル量 | 300 ng以上 |
濃度 | 100 ng/μL以上 |
溶媒 | Nuclease Free水(DEPC水不可) |
A260/A280 | 1.8以上 |
A260/A230 | 1.5以上 |
※ miRNA解析用total RNAの精製にはmiRNeasy mini kit (QIAGEN)等をご使用ください。
*サンプルは返却しませんので、必要量をお送りください。
*上記基準に満たない場合はご相談ください。
*ヒト臨床サンプルの場合、HIV、HCV等感染性のあるサンプルは受領できません。
*組織・細胞等からのtotal RNA精製も承ります。お気軽にお問い合わせください。
本解析の価格に関しましては、本機構までお問い合わせください。
お問い合わせ先はこちら。
まず、miRNAを含むtotal RNAをCIP(Calf Intestinal Phosphate)を用いて、脱リン酸化します。その後、T4 RNA Ligaseの働きによりCy3-pCpを5’末端に1分子のみ結合させてラベル化miRNAを合成し、ハイブリダイズを行います。
Agilent社のmiRNAマイクロアレイのプローブはmiRNAの相補的配列(Hybridization sequence)とヘアピンキャップ配列(extended hairpin)からなっています。ヘアピンキャップ構造の存在により、pre-miRNAやpri-miRNAはハイブリダイズできず、matureなmiRNAのみがハイブリダイズすることができ、miRNAの特異的で高感度な検出が可能です。
生物種(学名) | miRBase ver. | 16.0 | 15.0 | 14.0 | 12.0 | 10.1 | 9.1 |
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Human (Homo sapiens) |
mature miRNA数 | 1223 | 1100 | 904 | 866 | 733 | 470 |
マイクロアレイ | (8×60K予定)
近日発売 |
- | 8×15K Rel.14.0 |
8×15K Rel.12.0 |
8×15K Rel.10.1 |
8×15K Rel.9.1 |
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Mouse (Mus musculus) |
mature miRNA数 | 1055 | 717 | 710 | 627 | 579 | - |
マイクロアレイ | 近日発売 | 8×15K Rel.15.0 |
8×15K Rel.14.0 |
8×15K Rel.12.0 |
8×15K Rel.10.1 |
- | |
Rat (Rattus norvegicus) |
mature miRNA数 | 680 | 387 | 388 | 350 | 351 | - |
マイクロアレイ | 近日発売 | 8×15K Rel.15.0 |
- | - | 8×15K Rel.10.1 |
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