本受託解析は、RNAサンプル又は対象組織や細胞を本機構にお送りいただくだけで、Agilent社のマイクロアレイを使用して網羅的に遺伝子発現解析を行い、高品質なデータをご提供するものです。
〔解析手法の選び方〕
目的 | 項目 |
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遺伝子発現解析 |
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aCGH解析 |
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miRNA解析 |
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超微量/FFPEサンプルの遺伝子発現解析 |
各種カスタムアレイのデザインサポートも実施します
CERIでは
以下のような流れで受託解析を実施します。基本メニューとしてはお客様からtotal RNAをご送付いただくことからスタートします。
RNA品質検定 |
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マイクロアレイ実験 |
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データ解析 |
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報告書(印刷物)以外に、以下のデータを電子ファイルとして納品します。なお、報告書には方法、結果(考察)を含みます。
納品物 | (1)解析結果報告書(ハードコピー) (2)RNA品質検定結果(Excel及びPDFファイル) (3)画像データ(TIFFファイル)* (4)数値化データ(Textファイル) (5)QCレポート結果(PDFファイル) (6)各種解析データ(オプションメニュー) |
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納期 | 約3週間(サンプル受領から) |
*ご依頼内容によってはお渡しできない場合もあります
以下の条件に合ったtotal RNAサンプルをご準備ください。
種類 | total RNA(カラムフィルターで精製) |
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サンプル量 | 25〜200 ng (Low Input kit) |
濃度 | 20 ng/μL以上(推奨;100 ng/μL以上) |
溶媒 | Nuclease Free水(DEPC水不可) |
A260/A280 | 1.8以上 |
A260/A230 | 1.5以上 |
RIN※ | 5.0〜7.0以上 |
※RIN; RNA Integrity Numberの略であり、RNAの分解度を1〜10で数値化したもの。
10に近いほど分解していないRNAを表します。
*サンプルは返却しませんので、必要量をお送りください。
*上記基準に満たない場合はご相談ください。
*ヒト臨床サンプルの場合、HIV、HCV等感染性のあるサンプルは受領できません。
*組織・細胞等からのtotal RNA精製も承ります。お気軽にお問い合わせください。
本解析の価格に関しましては、本機構までお問い合わせください。お問い合わせ先はこちら。
ご依頼の目的など、こちらのフォームより可能な限り詳しくお知らせください。具体的な解析内容については、お客様とご相談の上決定させていただきますので、お気軽にお問い合わせください。 その他一般的なご依頼・ご相談手順についてはこちらをご覧ください。 ご相談の内容に基づき、費用・納期等をお知らせします。お見積り内容にご承諾いただけましたら、契約手続きに入らせていただきます。 その後、サンプルを本機構までご送付ください。サンプルの送付方法についてはこちらを参考にしてください。
なお、土日祝祭日はサンプルの受け取りができませんので、平日の9時から17時に本機構着となりますように、冷凍(ドライアイス同梱)にてお送りください。
アジレント社製オリゴマイクロアレイ解析には、1色法と2色法の2通りがあります。お客様の研究目的に合わせて、お選びいただけます。なお、原理についてはAgilent社プロトコール(18ページ目)をご参照ください。
1色法 | 2色法 | |
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用途 | ・データ解析の際の組み合わせが自由
・シグナル値レベル(5桁)での統計解析が可能 |
・2サンプル間の微小な差異を検出可能 (厳密な数値比較に強い) |
蛍光色素 | Cy3 | Cy3/Cy5 |
ノーマライズ方法 | グローバルノーマライゼーション | Lowessノーマライゼーション |
和名 | 学名 | アレイ | フォーマット |
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ヒト | Homo Sapiens | Whole Human Genome | ・8×60K(G3) ・4×44K |
マウス | Mus musculus | Whole Mouse Genome | |
ラット | Rattus norvegicus | Whole Rat Genome | |
ウマ | Equus caballus | Horse | ・4×44K |
犬 | Canis familiari | Canine (Dog) V2 | |
ハマダラ蚊 | Anopheles gambiae | Mosquito | |
線虫 | C.elegans | C. elegans (V2) | |
ブタ (ヨーロッパイノシシ) | Sus Scrofa | Porcine | |
ウサギ | Oryctolagus cuniculus | Rabbit | |
サケ | Salmo salar | Salmon | |
ヒツジ | Ovis aries | Sheep | |
ゼブラフィッシュ | Danio rerio | Zebrafish (V2) | |
キイロショウジョウバエ | Drosophila melanogaster | Drosophila | |
ウシ | Bovinae | Bovine | |
ニワトリ | Gallus gallus | Chicken | |
アカゲザル | Macaca mulatta | Rhesus Monkey | |
アフリカツメガエル | Xenopus laevis | Xenopus laevis |
和名 | 学名 | アレイ | フォーマット |
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タバコ | Nicotiana tabacum | Tobacco | ・4×44K |
トウモロコシ | Corn; Maize | Corn | |
イネ | イネ | ||
セイヨウアブラナ | Brassica napus | Brassica | |
ワタ | Gossypium hirsutum | Cotton | |
タルウマゴヤシ | Medicago truncatula | Medicago | |
オオムギ | Hordeum vulgar | Barley | |
コムギ | Triticum aestivum | Wheat | |
トマト | Solanum lycopersicum | Tomato | |
大豆 | Glycine max | ダイズ | |
シロイヌナズナ | Arabidopsis thaliana | Arabidopsis V4 | |
Rice いもち病菌 | Magnaporthe grisea | Magnaporthe grisea 2.0 |
和名 | 学名 | アレイ | フォーマット |
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出芽酵母 | Saccharomyces Cerevisiae | Yeast | ・4×44K |
マウス発生研究用 | Mouse 発生再生研究 | ||
ラット | Rat (V2) |